华大拥有目前世界一流的基因组测序、蛋白质组分析、生物信息分析和药物开发技术。其成熟完善程度、规模化应用程度、完成质量的稳定程度和工作效率，接近国际最先进机构的水平，已经被国际同行公认为亚洲和中国在这一领域的代表。华大的专有工艺和技术，使生产和科研成本远低于国际国内同类机构水平。
　　华大的技术平台已经实现研发和生产规模化。　基因测序分析平台装备了81台测序仪，占全国总量的三分之二。华大的研发能力已达到日产出3000万对碱基数据量，居世界第六位，是亚洲第一家，也是目前中国唯一一家从研究阶段就实现规模化的基因研发中心。
　　生物信息分析平台拥有每秒运算超百亿次的曙光2000超级计算机1台、每秒运算超千亿次的曙光3000超级计算机2台，这是目前中国运算速度最快的计算机。2台SUN 10000超级服务器也即将开始运行。这些设备的水平和规模，已远远超过全国同行业其他机构。
　　蛋白质组分析和天然药物开发两个技术平台预计在2001年10月底完成。蛋白质组分析平台拥有20套世界最先进的蛋白质组分析系统，日处理2000万个数据点，成为世界最大的蛋白质组分析中心之一。
　　天然药物开发平台拥有384孔板及1536孔板的全自动筛选系统，每年可处理100万个数据点，获得30多个生物靶分子，可筛选出相当一批候选药物。这个平台的药物筛选能力具有世界一流水平。