剑桥8月13日消息--- Vertex Pharmaceuticals Incorporated (Nasdaq: VRTX)今天在总部剑桥宣布公司已经装备了世界上最强大的超级计算机群用于新药的开发设计。这些超级计算机利用专利的软件和各种内部模型技术并行运作支持公司结构生物学，组合化学，医学化学，高通量筛选技术，生物信息学和制药小组之间的有效合作，它还能提供功能强大的工具分析细胞评价方法和超高通量筛选方法产生的复杂的数据和信息。这个计算机群装备了各个技术部门关键的结构和技术，有望加快公司在基因家族方面研究的步伐。

　　Vertex公司首席技术官员Mark Murcko, Ph.D说在过去的几年中，高性能计算机的使用在公司设计针对新型生物复合物药物候选产品方面发挥着关键的作用，在公司目前的生产线中，包括一个已经上市销售的产品和12个处于临床开发阶段的产品生产线，都是早期利用计算机进行药物开发的结果。现在的新计算机群适应了公司在化学基因组技术方面的扩大，功能变的更加强大以满足并行进行多种基因家族药物设计的需要。

　　这个超级计算机群是由Blackstone Computing (以前叫Blackstone Technology Group)为公司生产的，该公司是生命科学计算软件和服务方面的领头羊。计算机群的最初装备为56台计算机和112个处理器（933MHZPentium（R）III），理论上能够提供约110 gigaflips的运算能力（1100亿浮点运算/秒），相当与目前公司所用的超级计算机群的6倍快。该系统是可以改变的，允许将计算机扩大到450台，处理器扩大到900个以保证公司的需要。这个系统的显著特点是速度快，低延误时间，这就加快了处理器之间的信息交换，增强了复杂数据的处理能力。

　　Blackstone Computing 首席执行官和主席Brian Ritchie对于能与Vertex公司合作感到非常骄傲，因为这个公司能够将并行计算技术运用到药物开发中去，他说公司愿意帮助像Vertex一样的公司，为他们提供满足科学和业务需要的功能强大的计算机以协助他们取得成功。并行计算能够显著地加快大量计算机产生的化学文库的筛选工作，增强in silico蛋白抑制剂相互作用的检测能力以及分析这些复杂数据的能力，因此在药物开发中发挥的作用日益重要，而且它还能通过分析候选药物的分子动力学确认和筛选出具有巨大潜力的候选药物。

　　Vertex公司已经建立了巨大专利软件和计算方法数据库，可以利用并行计算进行小分子药物设计，其中包括：能够预测候选药物药理特性如生物利用度，毒性，半衰期和穿透血脑屏障能力的in silico筛选技术；帮助确认有潜力药物的抑制剂种类的分子模型和配体计算方法；基于候选药物新功能的优化实验方向的定量结构活性关系（QSAR）方法。Vertex公司的软件开发已经扩展到基因家族领域，对相似的蛋白靶物质化学文库进行分析和比较以方便挑选。

基因家族方面的药物开发

　　Vertex公司率先从事化学基因组领域工作，化学基因组就是将医学化学和人体基因组相结合，由于公司认识到基因和其编码的蛋白质可以根据结构情况进行家族划分，因此公司就对基因家族中的多个靶点并行进行药物设计。2001年7月，Vertex公司收购了Aurora Biosciences，使公司具备了先进的评价手段，筛选和细胞生物技术，有望大大增强公司在新基因家族中的药物开发能力。

Vertex制药公司

　　Vertex是一家全球性的生物技术制药公司，公司致力于单独或合作进行主要制药产品的发现，开发和商品化工作。化学基因组是公司设计的以基因为基础的系统的专利技术，能够促进新药的开发，扩大药品候选产品和相关复合物的知识产权覆盖范围。公司第一个获得批准的药物是与GlaxoSmithKline合作开发的HIV蛋白酶抑制剂Agenerase(R) (amprenavir)。公司还有12种治疗病毒性疾病，炎症，癌症，自身免疫性疾病和神经疾病的药物候选产品处于开发阶段。