核酸平台是杭州华大基因研发中心最重要的平台之一，主要承担中心所有大小项目的测序分析工作。在中心的发展历程中，核酸平台一直扮演着十分重要的角色，并始终战斗在探询生命奥秘的最前沿。从沙门氏菌基因组到水稻基因组“框架图”、“精细图”的绘制完成，核酸平台不仅出色的完成了工作任务，同时建立起一套完整的大规模基因组测序分析技术平台，锻炼了一支训练有素、团结拼搏、生机勃勃的人才队伍。

　　大规模基因组测序分析平台包括：大规模模板制备流水线和全自动DNA测序分析系统，以及全过程的质量控制与优化管理系统。由于在整个基因测序过程中引进了规模化、企业化的运行管理模式，使得测序费用不断地降低，速度不断加快，精确度不断提高，技术日趋完善。现该技术已成为寻找新基因，从整体研究生命科学的主流技术手段。

　　杭州华大现拥有 51 台 Amersham Pharmacia 公司生产的DNA自动分析仪和 2 台 ABI377 自动测序仪。该仪器是目前世界上最先进的 DNA 测序仪之一。采用国际上先进的 shotgun 策略，先将测序物种的全基因组 DNA 随机打断，构建随机文库，再进行随机测序，以后利用计算机进行自动拼接组装。无法拼接的部分再通过 PCR、分子标记等技术进行修补直至完成。

　　DNA自动分析仪是采用毛细管电泳，四色荧光标记，激光扫描分析的基本原理进行DNA测序分析。具有高通量，大规模，快速准确的特点。每次可同时分析96个样品，每个样品的DNA测序读长可达500bp以上，每天每台机器可以测6～10批样品。

　　公司提供以下几种基本测序分析，各种各样的模板均可进行测序，包括plasmids、cosmids、BACs、PACs、M13、PCR产物。 单一读长测序用于cDNA (ESTs) 的分析、克隆鉴定、剪切位点的验证，我们将为您提供两种服务，一种是约含500个碱基较短读长的测序，另一种是不少于600（一般为650~750）个碱基较长读长的测序。测序的准确率超过99%。 对已知的DNA序列进行鉴定 或对突变基因和基因缺失的检测。利用客户提供的引物通过引物步移法对DNA两条链进行测序，准确率高达99.95%。 即将公开的序列的完全测定，通过人工编辑和自动组装对DNA的两条链进行测序，准确率高达99.95%。

　　目前杭州华大与北京华大一起成为世界上最大的基因测序分析中心之一。所拥有的 81 台先进的DNA测序仪、2 台曙光3000超级计算机、2 台SUN10000超级服务器，以及完善的配套设备和先进的科研生产厂房。这些设备使华大现已具备大规模DNA测序和生物信息分析能力及获取基因专利的能力。DNA测序分析能力现已达到每日测定分析3000万对碱基数据量的水平，是目前全国其他机构能力总和的2倍，居全世界第6位。